Die Konsequenzen dieser Fehlbildung sind von der Position der Beschädigung der Wirbelsäule bzw. der damit verbundenen Nervenbahnen abhängig. Neurale Impulse können ihr Ziel nicht mehr auf normalen Weg erreichen, was zu mangelnder Muskelkraft in Verbindung mit Lähmung, reduzierter Mobilität, Taubheit, geringere Zirkulation in den Beinen und zu höheren Risiko einer Knochenfraktur führt. Viele Betroffene sind in einen Rollstuhl gefesselt. Der Neuralrohr-Defekt impliziert nicht nur reduzierte Mobilität, er beeinträchtigt auch viele andere Körperfunktionen. Neben anderen Dingen, ist die Blasen- und Rektum-Nervenfunktionalität zu 90% beeinträchtigt bzw. 80% bei Kindern mit Neuralrohr-Defekt.
Über 80% der erkrankten Kinder leiden unter dem sogenannten Hydrocephalus, was bedeutet, dass die Flüssigkeit, die im Gehirn entsteht, nicht frei zirkulieren kann. Die Flüssigkeit verbleibt in der Hirnhöhle und übt Druck auf den weichen Schädelknochen des Neugeborenen aus, der sich dann vergrößert und der Kopf wächst. Dies kann durch einen chirurgisch plazierten druckablassenden Shunt, der aus einem dünnen Schlauch mit einem druckregulierenden Ventil besteht, behandelt werden. Die angeborene Gehirnveränderung und der Druck, der auf das Gehirn ausgeübrt wird, kann zu verspäterter Pubertät, reduzierter Feinmotorik, aber auch zu typischen kognitiven Problemen, wie geringes Erinnerungsvermögen, Wahrnehmungsstörungen und reduzierter Handlungsfähigkeit führen.